B.1.1.7 convirtiéndose rápidamente en la variante dominante del SARS-CoV-2 en los Estados Unidos



La variante B.1.1.7 de SARS-CoV-2 de propagación más rápida detectada por primera vez en el Reino Unido, el coronavirus que causa COVID-19, está rápidamente en camino de convertirse en la variante dominante del virus en los Estados Unidos, según a un estudio de científicos de Scripps Research y el fabricante de pruebas de COVID-19 Helix.

Los hallazgos, que aparecen hoy en Célula, sugieren que el número de casos futuros de COVID-19 y las tasas de mortalidad en los Estados Unidos serán más altos de lo que hubieran sido de otra manera. El análisis sugiere que la variante, que se ha detectado en una proporción cada vez mayor de muestras de SARS-CoV-2, es entre un 40 y un 50 por ciento más transmisible que los linajes de SARS-CoV-2 que anteriormente eran dominantes. Otros estudios han encontrado evidencia de que la variante B.1.1.7 puede tener aproximadamente un 50 por ciento más de probabilidades de causar un COVID-19 fatal.

“B.1.1.7 se convirtió rápidamente en la variante dominante del SARS-CoV-2 en el Reino Unido y otros países después de su aparición a fines del año pasado, y Estados Unidos se encuentra ahora en una trayectoria similar”, dice la coautora principal del estudio, Kristian Andersen, PhD , profesor en el Departamento de Inmunología y Microbiología de Scripps Research y director de Genómica de Enfermedades Infecciosas en el Instituto de Investigación Traslacional de Investigación Scripps. “Necesitamos una acción inmediata y decisiva para minimizar la morbilidad y mortalidad de COVID-19”.

Además de Andersen, el otro autor principal fue William Lee, PhD, vicepresidente de ciencia en Helix, que proporciona pruebas de COVID-19 basadas en PCR a organizaciones de todo Estados Unidos. El estudio también fue escrito por Nicole Washington, PhD, directora asociada de investigación en Helix, y Karthik Gangavarapu del Andersen Lab.

B.1.1.7 tiene una tasa de duplicación de poco más de una semana y una tasa de transmisión aumentada del 40-50 por ciento, lo que significa que podría tener un impacto significativo en la salud pública. Es fundamental que sigamos monitoreando la propagación de esta y otras variantes emergentes, pero nuestro nivel actual de vigilancia es inadecuado y está por detrás del de otros países. Necesitamos un programa nacional de vigilancia genómica del SARS-CoV-2 más completo para abordar esto “.

William Lee, PhD, vicepresidente de ciencia de Helix

La variante B.1.1.7 surgió en el sur de Inglaterra el año pasado y desde entonces se ha convertido en la variante dominante en el Reino Unido. En diciembre, el equipo de Andersen en Scripps Research con colegas de la Universidad de California en San Diego confirmaron la primera evidencia de la variante en California.

Un patrón de dominio

La variante B.1.1.7 contiene varias mutaciones, incluidas varias en el gen que codifica la proteína pico viral. Estas mutaciones aumentan la capacidad de la espiga para unirse al receptor ACE2 en las células humanas. Aunque todavía no hay evidencia de que la variante B.1.1.7 pueda evadir las vacunas COVID-19, los funcionarios de salud pública temen que su tasa relativamente alta de propagación empeore significativamente la pandemia antes de que las vacunas puedan ponerle fin.

Las pruebas de hisopo estándar para el coronavirus verifican secuencias genéticas distintivas en tres sitios del genoma viral; la variante B.1.1.7, debido a sus mutaciones, aparece como positiva para dos de esos sitios, pero negativa para el tercer sitio, que se encuentra dentro del gen espiga del virus.

El nuevo análisis de aproximadamente 500,000 resultados de la prueba Helix desde julio de 2020 reveló que este patrón de dos de tres, conocido como falla del objetivo del gen S, o SGTF, se hizo evidente de manera consistente con una frecuencia baja (0.2 por ciento) a mediados de octubre. Para la tercera semana de febrero, había aumentado a una frecuencia del 10,6 por ciento y se detectó en pacientes de 25 estados y territorios diferentes de EE. UU.

El patrón SGTF puede ocurrir con otras variantes de SARS-CoV-2 que tienen mutaciones genéticas de pico, pero los investigadores encontraron al secuenciar cada muestra de SGTF que tenían de diciembre a febrero, 662 de las 986 muestras (67 por ciento) contenían B.1.1. 7 variante. Esto sugiere que el patrón SGTF en las pruebas de hisopo puede proporcionar una indicación rápida, aunque aproximada, de la prevalencia de B.1.1.7.

La variante entró al país muchas veces.

El análisis también indicó que B.1.1.7 desde diciembre ha representado una proporción en rápido aumento de los resultados del SGTF, por ejemplo, alcanzando alrededor del 95 por ciento en California a mediados de enero. Además de los 659 casos B.1.1.7 que detectaron a través del método SGTF, los investigadores encontraron otros tres casos de la variante B.1.1.7 entre las muestras recolectadas como parte de los esfuerzos de vigilancia genómica del SARS-CoV-2 sin sesgos en California.

Las 662 instancias de B.1.1.7 secuenciadas en el estudio fueron de muestras recolectadas en 10 estados de EE. UU., Aunque los investigadores señalan que otros laboratorios de pruebas que cubren un total de 33 estados y territorios de EE. UU. Ya han informado a los CDC al menos una B .1.1.7 caso.

El análisis del tipo de árbol genealógico de los investigadores de las secuencias de B.1.1.7 detectadas muestra que la variante se ha introducido en los EE. UU. Varias veces desde al menos fines de noviembre de 2020, especialmente en California y Florida, y en períodos que coinciden con un aumento de viajes, incluido Semana de Acción de Gracias.

Los científicos también encontraron que la variante, en general, parece propagarse entre un 40 y un 50 por ciento más rápido que las variantes de SARS-CoV-2 que dominaban anteriormente. Estimaron que para la primera semana de febrero de 2021, B.1.1.7 constituía aproximadamente el 4,3 por ciento de los casos de COVID-19 en los EE. UU., Incluido el 4,2 por ciento de los casos en California y aproximadamente el 11,5 por ciento de los casos en Florida.

Fuente:

Referencia de la revista:

Washington, NL, et al. (2021) Aparición y transmisión rápida del SARS-CoV-2 B.1.1.7 en los Estados Unidos. Célula. doi.org/10.1016/j.cell.2021.03.052.

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