El análisis muestra que el distanciamiento social ayudó a reducir la transmisión nosocomial del SARS-CoV-2 en Londres

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Los nuevos casos de coronavirus 2 (SARS-CoV-2) del síndrome respiratorio agudo severo en el Reino Unido alcanzaron un pico durante la primera ola de la pandemia de COVID-19. En el Reino Unido se implementaron agresivas intervenciones no farmacéuticas como el distanciamiento social y los bloqueos para frenar la propagación del virus a fines de marzo. Dado que el SARS-CoV-2 es un virus nuevo y las personas no tenían inmunidad previa al virus, las organizaciones de salud intentaron adaptarse a la pandemia con nuevas políticas de control de infecciones y medidas no farmacéuticas durante las primeras semanas de la pandemia.

Las principales intervenciones preventivas introducidas incluyeron políticas de distanciamiento social de la comunidad que llevaron al cierre obligatorio a nivel nacional, la restricción de visitantes al hospital y el uso universal de mascarillas quirúrgicas por parte de los trabajadores de la salud. Con respecto a la incidencia de SARS-CoV-2, los casos nosocomiales, los casos comunitarios y la infección en una cohorte de atención médica siguieron el mismo curso y disminuyeron poco después de la introducción de medidas de distanciamiento social comunitario. La alta prevalencia de infección complica el análisis de transmisión y, por lo tanto, la contribución de varios vectores a la infección nosocomial o la efectividad de estas intervenciones no farmacéuticas no está clara.

Actualmente, la segunda ola de la pandemia está en curso en muchos países, incluido el Reino Unido, y los sistemas de atención médica están abrumados con hospitales que se preparan para una mayor afluencia de pacientes con COVID-19. Por lo tanto, es esencial recopilar los datos de las primeras semanas de la pandemia para ayudar a las organizaciones de atención médica a planificar futuros aumentos de casos.

Descripción epidemiológica de los casos diagnosticados durante la primera ola.  En el eje y de la izquierda, el gráfico de barras grises muestra nuevos casos a lo largo del tiempo entre el 10 de marzo y el 31 de abril.  Durante el mismo período, el eje y de la derecha muestra la incidencia de casos nosocomiales (línea naranja) y la proporción (%) de PS examinados con infección confirmada que notifica el inicio de los síntomas (línea negra) con período máximo de infectividad ± 2 días (línea negra discontinua ), con seroprevalencia de IgG de HCW (verde).  Se superponen 5 fechas clave en políticas públicas y control de infecciones (A) 13 de marzo;  prueba recomendada para todos los pacientes hospitalizados con tos y fiebre.  (B) 16 de marzo;  fuerte asesoramiento gubernamental para el distanciamiento social;  (C) 23 de marzo;  implementación del cierre nacional (D) 25 de marzo;  exclusión de visitantes del hospital (E) 28 de marzo;  uso obligatorio de mascarillas quirúrgicas para todas las interacciones con el paciente por debajo de 2 metros.

Descripción epidemiológica de los casos diagnosticados durante la primera ola. En el eje y de la izquierda, el gráfico de barras grises muestra nuevos casos a lo largo del tiempo entre el 10 de marzo y el 31 de abril. Durante el mismo período, el eje y de la derecha muestra la incidencia de casos nosocomiales (línea naranja) y la proporción (%) de PS examinados con infección confirmada que notifica el inicio de los síntomas (línea negra) con período máximo de infectividad ± 2 días (línea negra discontinua ), con seroprevalencia de IgG de HCW (verde). Se superponen 5 fechas clave en políticas públicas y control de infecciones (A) 13 de marzo; prueba recomendada para todos los pacientes hospitalizados con tos y fiebre. (B) 16 de marzo; fuerte asesoramiento gubernamental para el distanciamiento social; (C) 23 de marzo; implementación del cierre nacional (D) 25 de marzo; exclusión de visitantes del hospital (E) 28 de marzo; uso obligatorio de mascarillas quirúrgicas para todas las interacciones con el paciente por debajo de 2 metros.

Análisis epidemiológico y genómico combinado de casos nosocomiales de SARS-CoV-2

Recientemente, un equipo de investigadores del King’s College London, Guy’s and St Thomas ‘NHS Foundation Trust y St Thomas’ Hospital, Londres, analizaron datos exhaustivos de secuencias de nanoporos virales y epidemiológicos de 574 pacientes con infección por SARS-CoV-2 confirmada por una PCR. prueba en marzo de 2020. Este análisis genómico y epidemiológico combinado abarca 19 días de transmisión comunitaria masiva en Londres durante los primeros meses de la pandemia, que fue la principal duración de la transmisión nosocomial, con 90 casos nosocomiales definitivos o probables en toda la institución de salud.

Este estudio se publica en el servidor de preimpresión medRxiv*.

El equipo analizó grupos de casos nosocomiales basados ​​en estancias en sala superpuestas durante el período de incubación de 14 días y la similitud en la secuencia del genoma del SARS-CoV-2. Este método agrupó 63 (79%) de 80 casos nosocomiales probables y confirmados secuenciados en 14 grupos con una mediana de 4 pacientes.

No pudieron encontrar ningún apoyo genético para la mayoría de los grupos epidemiológicos y la genómica reveló la presencia de varios brotes contemporáneos en grupos epidemiológicos únicos. Los investigadores midieron y compararon el enriquecimiento hospitalario con los casos comunitarios para aumentar la confianza en los grupos, que se enriquecieron de 1 a 14 veces.

Los trabajadores sanitarios infectados fueron los principales contribuyentes a la transmisión nosocomial durante la primera ola

Al aplicar la genómica, pudieron estimar el período de incubación para la transmisión nosocomial, con una mediana del límite inferior de 6 días y un límite superior de 9 días. Seis (43%) grupos abarcaron múltiples salas y hubo evidencia de transmisión críptica. No se encontraron casos de inicio comunitario en más de la mitad de los conglomerados, especialmente en el sitio del hospital electivo, lo que demuestra que los trabajadores de la salud son los vectores de transmisión. Con base en estos hallazgos, los autores concluyeron que el distanciamiento social de la comunidad tuvo un impacto dominante en la reducción de la transmisión nosocomial al reducir la infección en los trabajadores de la salud.

En resumen, este estudio respalda el uso rutinario de la secuenciación del genoma para investigar los brotes de SARS-CoV-2 y ofrece un marco para la interpretación de datos que cuestiona la dependencia excesiva del uso de la epidemiología solo en estas investigaciones. Los datos recopilados de este estudio muestran que los trabajadores de la salud infectados en la comunidad fueron los principales contribuyentes a la transmisión nosocomial durante la primera ola de la pandemia de COVID-19, y esta transmisión fue interrumpida por la implementación de medidas de distanciamiento social comunitario.

Durante la segunda ola, el regreso de la transmisión comunitaria ofrece una oportunidad para examinar si la transmisión nosocomial regresa con la misma intensidad mientras se implementan políticas de uso universal de máscaras y de distanciamiento social. Esto ayudará a decidir si se requieren intervenciones adicionales como pruebas regulares o secuenciación rápida del genoma para detener la transmisión nosocomial. Actualmente, un ensayo clínico en varios sitios está investigando si la secuenciación en tiempo real para analizar los brotes puede ayudar a los equipos de control de infecciones a interrumpir la transmisión viral.

“En resumen, este estudio respalda el uso rutinario de la secuenciación del genoma para la investigación del brote de SARS-CoV-2 y proporciona un marco para la interpretación de datos que cuestiona la dependencia continua del uso de la epidemiología únicamente”.

*Noticia importante

medRxiv publica informes científicos preliminares que no son revisados ​​por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, guiar la práctica clínica / comportamiento relacionado con la salud o tratarse como información establecida.

Referencia de la revista:

  • El análisis epidemiológico y genómico combinado de la transmisión nosocomial del SARS-CoV-2 identifica el distanciamiento social de la comunidad como la intervención dominante para reducir los brotes Luke B Snell, Chloe L Fisher, Usman Taj, Blair Merrick, Adela Alcolea-Medina, Themoula Charalampous, Adrian W Signell, Harry D Wilson, Gilberto Betancor, Mark Tan Kia Ik, Emma Cunningham, Penelope R Cliff, Suzanne Pickering, Rui Pedro Galao, Rahul Batra, Stuart JD Neil, Michael H Malim, Katie J Doores, Sam T Douthwaite, Gaia Nebbia, Jonathan D Edgeworth , Ali R Awan, el consorcio COVID-19 Genomics UK (COG-UK) medRxiv 2020.11.17.20232827; doi: https://doi.org/10.1101/2020.11.17.20232827, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.11.17.20232827v1

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