El estudio proporciona una visión detallada de los sitios vulnerables en el SARS-CoV-2



Un nuevo estudio dirigido por científicos del Instituto de Inmunología de La Jolla (LJI) sugiere que Células T Intente combatir el SARS-CoV-2 dirigiéndose a una amplia gama de sitios en el virus, más allá de los sitios clave en la proteína de pico del virus. Al atacar al virus desde muchos ángulos, el cuerpo tiene las herramientas para reconocer potencialmente diferentes variantes del SARS-CoV-2.

La nueva investigación, publicada el 27 de enero de 2021 en Medicina del informe celular, es el análisis más detallado hasta ahora de qué proteínas del SARS-CoV-2 estimulan las respuestas más fuertes de las células T CD4 + “auxiliares” del sistema inmunológico y las células T CD8 + “asesinas”.

“Ahora estamos armados con el conocimiento de qué partes del virus son reconocidas por el sistema inmunológico”, dice el profesor de LJI, Alessandro Sette, Dr. Biol. Sci., Quien codirigió el nuevo estudio con la instructora de LJI Alba Grifoni, Ph.D.

Sette y Grifoni han dirigido investigaciones sobre las respuestas inmunitarias al virus desde el comienzo de la pandemia. Sus estudios anteriores, codirigidos por miembros del Grupo de Trabajo sobre el Coronavirus de LJI, muestran que las personas pueden tener una amplia gama de respuestas al virus; algunas personas tienen fuertes respuestas inmunitarias y les va bien. Otros tienen respuestas inmunes desarticuladas y es más probable que terminen en el hospital.

A medida que las vacunas COVID-19 llegan a más personas, los científicos de LJI vigilan cómo diferentes personas desarrollan inmunidad al SARS-CoV-2. También están estudiando cómo las células T podrían combatir diferentes variantes del SARS-CoV-2. Este trabajo aprovecha la experiencia del laboratorio para predecir y estudiar las respuestas de las células T a virus como el dengue y el Zika.

“Esto es aún más importante con COVID-19 porque es una pandemia mundial, por lo que debemos tener en cuenta las respuestas inmunitarias en diferentes poblaciones”, dice Grifoni.

El sistema inmunológico es muy flexible. Al volver a mezclar el material genético, puede producir células T que responden a una amplia gama de objetivos, o epítopos, en un patógeno. Algunas respuestas de células T serán más fuertes contra algunos epítopos que contra otros. Los investigadores llaman “inmunodominantes” a los objetivos que provocan una fuerte respuesta de las células inmunitarias.

Para el nuevo estudio, los investigadores examinaron las células T de 100 personas que se habían recuperado de la infección por SARS-CoV-2. Luego observaron de cerca la secuencia genética del virus para separar los epítopos potenciales de los epítopos que estas células T reconocerían realmente.

Su análisis reveló que no todas las partes del virus inducen la misma fuerte respuesta inmune en todos. De hecho, las células T pueden reconocer docenas de epítopos en el SARS-CoV-2, y estos sitios inmunodominantes también cambian de persona a persona. En promedio, cada participante del estudio tuvo la capacidad de reconocer aproximadamente 17 epítopos de células T CD8 + y 19 epítopos de células T CD4 +.

Esta amplia respuesta del sistema inmunológico tiene varios propósitos. El nuevo estudio muestra que, si bien el sistema inmunológico a menudo genera una fuerte respuesta contra un sitio en particular en la proteína “pico” del virus llamada dominio de unión al receptor, esta región en realidad no es tan buena para inducir una fuerte respuesta de las células T auxiliares CD4 +.

Sin embargo, sin una fuerte respuesta de las células T CD4 +, las personas pueden tardar en desarrollar el tipo de respuesta inmune neutralizante que rápidamente elimina el virus. Afortunadamente, la respuesta inmunitaria amplia es útil y la mayoría de las personas tienen células inmunitarias que pueden reconocer sitios distintos al dominio de unión al receptor.

Entre los muchos epítopos que descubrieron, los investigadores identificaron varios epítopos adicionales en la proteína de pico del SARS-CoV-2. Grifoni dice que estas son buenas noticias. Al apuntar a muchos sitios vulnerables en la proteína de pico, el sistema inmunológico aún podría combatir la infección, incluso si algunos sitios del virus cambian debido a mutaciones.

“La respuesta inmune es lo suficientemente amplia como para compensar eso”, dice Grifoni.

Desde el anuncio de la variante británica de rápida propagación del SARS-CoV-2 (llamada SARS-CoV-2 VUI 202012/01), los investigadores han comparado los sitios mutados en ese virus con los epítopos que encontraron. Sette señala que las mutaciones descritas en la variante del Reino Unido para la proteína de pico afectan solo al 8% de los epítopos reconocidos por las células T CD4 + en este estudio, mientras que se conserva el 92% de las respuestas.

Sette enfatizó que el nuevo estudio es el resultado de meses de largas horas y la colaboración internacional entre los laboratorios de LJI; la Universidad de California, San Diego; e investigador de la Universidad Murdoch de Australia. “Fue una gran cantidad de trabajo y pudimos hacerlo muy rápido gracias a nuestras colaboraciones”, dice.

Fuente:

Referencia de la revista:

Tarke, A., et al. (2021) Análisis completo de la inmunodominancia de las células T y la inmunoprevalencia de los epítopos del SARS-CoV-2 en los casos de COVID-19. Cell Reports Medicine. doi.org/10.1016/j.xcrm.2021.100204.

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