¿La cuarta ola de COVID-19 de Hong Kong se debe a la variante Q57H SARS-CoV-2?


Cuatro oleadas sucesivas de infección con el síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2), que ha causado la pandemia en curso de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19), han afectado a Hong Kong.

Un artículo reciente de los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) Enfermedades infecciosas emergentes revela que el último de estos probablemente se debió a la introducción de una nueva variante de Nepal. Esta nueva variante había estado circulando en la comunidad durante aproximadamente un mes antes de que se informara del último brote.

Se ha identificado que el SARS-CoV-2 ha evolucionado en varios clados de la cepa original de Wuhan. En el artículo actual, los investigadores se centraron en la variante del clado GH, que ha demostrado inducir bajos niveles de inflamación y de genes estimulados por interferón en células de las vías respiratorias humanas, en cultivo.

Estudio: Introducción de la variante ORF3a-Q57H SARS-CoV-2 que causa la cuarta ola epidémica de COVID-19, Hong Kong, China.  Haber de imagen: Imilian / Shutterstock

Los brotes de Hong Kong

Hong Kong tuvo cuatro oleadas de COVID-19, con un total de 10,400 casos en febrero de 2021. La oleada 3 (finales de junio a septiembre de 2020) se rastreó a una única introducción de una variante viral del clado GR, mientras que la oleada 4 (noviembre de 2020) hasta el presente) es causada por una variante del clado GH.

Introducción y difusión comunitaria

Aunque el brote actual comenzó en noviembre de 2020, los investigadores ya habían encontrado, a principios de octubre, genomas virales casi idénticos de dos grupos de pacientes de dos complejos de edificios en el mismo distrito. Todos mostraron la misma variante de GH de clado, a diferencia de los casos que ocurrieron durante la tercera ola.

Nuestros resultados indican que este virus GH del clado recién introducido estaba circulando en la comunidad local ≈1 mes antes del comienzo de la cuarta ola epidémica en Hong Kong.. ”

Sin embargo, encontraron que tres de cuatro pacientes con infección importada en un solo grupo cerca de los casos índice, así como otros dos pacientes en otro distrito, tenían los mismos genomas virales. Todos estos pacientes estaban en cuarentena obligatoria y habían llegado en el mismo vuelo en la segunda semana de septiembre de 2020, desde Nepal.

Los primeros tres pacientes fueron puestos en cuarentena en otro hotel cerca de los dos edificios ya mencionados, mientras que los otros dos pacientes se encontraban en un hotel en otro distrito. Un cuarto paciente en el primer hotel desarrolló COVID-19 a pesar de haber dado negativo dos veces, al llegar y después de 12 días, mientras aún estaba en cuarentena.

Esto podría indicar que este paciente tuvo un período de incubación muy largo después de haber sido infectado en Nepal o que se infectó durante el vuelo. Dio positivo solo después de que salió de la cuarentena. Esto presenta una posible vía de introducción de este virus de clado GH en la comunidad local.

Por supuesto, puede haber llegado a través de otra cadena de transmisión no detectada.

Perfil de mutación

El análisis del genoma viral muestra que este virus tiene las siguientes mutaciones, a saber: RdRp[L323P] que afectan a la ARN polimerasa dependiente de ARN, la mutación de pico D614G, el marco de lectura abierto 3a ORF3a Q57H, ORF3bE14 y las mutaciones de la nucleocápside N S194L.

De estos, la mutación Q57H conduce al truncamiento de ORF3b E14, que afecta a ORF3b, un antagonista importante de la vía del interferón. Este virus de la ola 4 se comparó con el virus de la ola 3, que solo tiene D614G, y con la ola 1, que no tiene D614G ni Q57H.

Sin ventaja de replicación

El estudio de la replicación viral en cultivos de órganos humanos y organoides de las vías respiratorias humanas mostró que el virus de la onda 4 en el tejido bronquial humano tenía una tasa de replicación equivalente a la del virus de la onda 1. En los tejidos pulmonares, sin embargo, se replicó más lentamente que el otro, cuando se evaluó a las 48 horas, 72 horas y 96 horas.

Por el contrario, el virus de la onda 3 se replicó ligeramente más rápidamente que el virus de la onda 1 en el cultivo de células de bronquio humano, pero no en cultivos de pulmón humano. Por lo tanto, el virus de la ola 3 puede ser mejor en la replicación viral que el virus de la ola 1.

No induce inflamación.

Con respecto a la naturaleza inflamatoria del virus, estos investigadores ya habían demostrado que el virus de la ola 1 era incapaz de inducir mediadores inflamatorios potentes, como lo demuestran los bajos niveles de citocinas y quimiocinas inflamatorias en las células humanas infectadas.

La mutación Q57H no cambió esta propiedad. Cuando se probó en cultivos de organoides respiratorios humanos, se encontró que el ácido ribonucleico viral (ARN) de las células infectadas con el virus de la ola 3 o el virus de la ola 4 era incluso más bajo que en las células infectadas por el virus de la ola 1, en aproximadamente una unidad logarítmica.

Cuales son las conclusiones?

Por tanto, el virus de la onda 4 provocó bajas citocinas, quimiocinas y expresión génica estimulada por interferón, como el virus de la onda 1. Sin embargo, el virus de la onda 3 provocó una mayor expresión génica que el virus de la onda 1, como se muestra mediante la medición de la proteína 10 inducida por interferón-γ.

A pesar de la principal deleción de ORF3b, nuestros resultados demuestran que el virus de la onda 4 no tiene una capacidad mejorada para replicarse ex vivo y conserva una potente capacidad de evasión inmune innata en nuestros modelos experimentales.. “

El virus de la onda 3 tiene algunas mutaciones únicas, principalmente en el gen ORF1ab y N. Es algo mejor en la replicación que los virus de la onda 1 o de la onda 4, y puede provocar una respuesta inmune innata más robusta, según las observaciones realizadas en los modelos experimentales.

Sin embargo, los hallazgos indican que el mutante SARS-CoV-2 responsable de la cuarta ola de COVID-19 en Hong Kong no se replica más rápido que las variantes anteriores, ni induce reacciones inflamatorias poderosas. La necesidad de políticas estrictas de contención sigue siendo imperativa, dada la naturaleza altamente localizada de los casos índice.

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