La mutación T478K del SARS-CoV-2 se propaga a una velocidad alarmante en México


Varias variantes preocupantes del coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2) se caracterizan por mutaciones en el dominio de unión al receptor y son más significativas proteína de pico que mejoran la virulencia al aumentar la afinidad de esta región por el receptor ACE2 diana que se encuentra en la superficie de las células, y potencialmente podrían evadir mejor los anticuerpos generados por la vacuna que son específicos de la proteína de pico de tipo salvaje. El genoma del SARS-CoV-2 ha estado sujeto a un escrutinio continuo desde las primeras etapas de la pandemia y, en la actualidad, casi un millón de secuencias se han compartido públicamente a través de varios bancos de datos en línea. Esto ha permitido un grado nunca antes visto de análisis en tiempo real de la naturaleza cambiante del genoma, que ha sido explotado en un artículo subido recientemente al servidor de preimpresión. bioRxiv* por Giacomo et al. (29 de Marzoth, 2021) para identificar una nueva mutación de proteína de pico que ha aumentado en frecuencia entre la población desde principios de 2021.

Nuevas mutaciones frecuentes del SARS-CoV-2

El grupo accedió a 827,572 secuencias genómicas del SARS-CoV-2 disponibles públicamente en el banco de datos en línea de la iniciativa científica global al 26 de marzo.th, 2021, y los comparó con el genoma de tipo salvaje del SARS-CoV-2 de referencia, descubriendo casi 17 millones de eventos de mutación. Tras traducir estas secuencias en estructuras proteicas tridimensionales, el grupo identificó la nueva mutación T478K en el complejo de interacción de la proteína de pico ACE2, que existía en 4.214 pacientes con COVID-19.

La variante B.1.1.222 se detectó por primera vez en México en abril de 2020 y la mutación T478K está presente en alrededor del 65% de las ocurrencias de esta cepa. De las 4.214 muestras que el grupo descubrió que portaban esta mutación, el 86% eran de la variante B.1.1.222. El resto eran de varios linajes distintos, lo que sugiere que esta mutación se ha producido en múltiples eventos de mutación distintos. Esta mutación estuvo presente en el 38,1% de todos los casos en México y el 1,3% en los EE. UU. Y también se detectó con poca frecuencia en algunos países europeos.

La frecuencia de la mutación T478K ha aumentado exponencialmente desde principios de 2021, de manera similar a otra mutación en la proteína de pico: D614G, que el grupo también rastreó a lo largo del tiempo. Se informó que D614G surgió poco antes que T478K y comenzó a aumentar rápidamente en frecuencia a fines de 2020. Actualmente, alrededor del 90% de los genomas del SARS-CoV-2 portan la mutación D614G, lo que muestra el rápido ascenso a la prominencia de esta mutación, que al parecer aumenta la virulencia. promoviendo la entrada en la célula huésped. Actualmente, solo alrededor del 2% de la población total de SARS-CoV-2 porta la mutación T478K, según este trabajo, aunque si la mutación aumenta la virulencia de manera similar, entonces puede elevarse correspondientemente a la dominancia.

Representación 3D del complejo de interacción SARS-CoV-2 Spike / Human ACE2

Representación 3D del complejo de interacción SARS-CoV-2 Spike / Human ACE2

La mutación T478K

La mutación T478K constituye el intercambio del aminoácido treonina no cargado con la lisina cargada positivamente en la posición 478 y abarca aproximadamente los aminoácidos 350 a 550 de la proteína espiga del SARS-CoV-2. El intercambio de aminoácidos en esta posición facilita la presentación de una superficie electrostática diferente que puede alterarse aún más por mutaciones concurrentes, interactuando potencialmente con receptores, anticuerpos y fármacos de manera más fuerte o débil. Se encontró que otras tres mutaciones de pico ocurren en paralelo con T478K con frecuencia: D614G, que representa una de las mutaciones fundadoras del linaje B y, por lo tanto, tuvo una co-ocurrencia del 99,8%; P681H, con 95,2% de co-ocurrencia; y T732A, con 91,4% de co-ocurrencia. Actualmente se desconoce cómo estos aminoácidos interactúan para mejorar la virulencia del SARS-CoV-2. Sin embargo, los autores destacan los resultados de otro grupo, donde se observó el desarrollo de mutaciones T478K y T478R en el SARS-CoV-2 tratado con débil anticuerpos neutralizantes, lo que sugiere que esta mutación podría ayudar a evadir la respuesta inmune.

Aún no hay ninguna indicación clínica de que T478K aumente la virulencia, sin embargo, la posición del aminoácido mutante en la punta del punto de interacción con ACE2 en asociación con el rápido aumento en la frecuencia observado recientemente en México y el sur de EE. UU. Puede indicar que esto es el caso. Las mutaciones en esta región sensible de la proteína de pico a menudo reducen la afinidad y, por lo tanto, el hecho de que la variante se esté multiplicando en la población humana sugiere validez de supervivencia. Este trabajo subraya la importancia de monitorear la aparición y propagación de mutantes del SARS-CoV-2 para asesorar mejor las políticas públicas y el desarrollo de vacunas.

*Noticia importante

bioRxiv publica informes científicos preliminares que no son revisados ​​por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, guiar la práctica clínica / comportamiento relacionado con la salud o tratarse como información establecida.

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