Los investigadores desarrollan un método rápido para identificar mutantes del SARS-CoV-2 resistentes a anticuerpos


Investigadores en los Estados Unidos han descrito un nuevo método rápido para identificar mutantes resistentes a anticuerpos en el síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2).

El SARS-CoV-2 es el agente causal subyacente de la pandemia mundial de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19), identificada por primera vez en Wuhan, China, en diciembre de 2019. Desde entonces, han surgido múltiples variantes del virus con ciertas mutaciones que les permiten ser más transmisibles o para escapar de la neutralización de los anticuerpos.

Estas mutaciones de escape son la principal preocupación, ya que las cepas virales resistentes a anticuerpos pueden reducir drásticamente la eficacia de terapias actuales con vacunas y anticuerpos.

Estudio: Identificación única de mutantes de escape de SARS-CoV-2 S RBD mediante detección de levadura.  Haber de imagen: vchal / Shutterstock

Ahora, un equipo de científicos de la Universidad de Colorado y otras instituciones informan sobre un método de detección de levaduras que se puede utilizar para identificar rápidamente mutantes de escape para anticuerpos neutralizantes (nAbs).

Identificamos mutantes de escape para cinco nAb, incluidos tres de la clase de línea germinal pública VHC-53 provocada por la infección natural por COVID-19 ”, dicen los autores. “Ofrecemos bibliotecas, métodos y software como un recurso comunitario disponible abiertamente para acelerar nuevas estrategias terapéuticas contra el SARS-CoV-2”.

Una versión preimpresa del trabajo de investigación está disponible para leer en su totalidad en el bioRxiv*servidor.

¿Qué hicieron los investigadores?

Comprender los roles y funciones de las mutaciones del SARS-CoV-2 jugará un papel muy importante en el desarrollo de suficientes vacunas, refuerzos y terapias con anticuerpos. La única proteína de la membrana viral responsable de la entrada celular es la proteína de pico (S), que se une a los huéspedes a través del dominio de unión al receptor (RBD). Los investigadores deseaban desarrollar un ensayo de detección funcional que pudiera identificar mutantes de escape de nAb a gran escala.

Se creó y probó una plataforma de visualización de superficie de levadura (YSD) S RBD para medir y predecir la escapabilidad de RBD. A través de pruebas con un panel de once anticuerpos anti-S RDB, pudieron concluir que (con la excepción del epítopo S309), la plataforma de levadura fue capaz de emular “fielmente” las interacciones de unión de los anticuerpos neutralizantes con S RBD.

Luego, los investigadores intentaron identificar mutantes de escape S RBD, utilizando cinco nAbs que pudieron bloquear la unión de ACE2 del SARS-CoV-2. Identificaron 97 mutaciones S RBD en pseudovirus del SARS-CoV-2 que podrían escapar al reconocimiento de al menos un anticuerpo neutralizante. Principalmente, las mutaciones F486I, E484K, T478R, K417N, K417T y D420K pudieron escapar por completo de la neutralización de los anticuerpos comunes y coincidieron con estudios previos que confirmaron que la mutación N501Y, presente en muchas variantes de interés, no tenía ningún papel en proporcionar resistencia a los anticuerpos. probablemente, en cambio, aumenta la afinidad de unión por ACE2.

Estos hallazgos se confirmaron utilizando réplicas biológicas de una biblioteca pública de variantes de SARS-CoV-2, lo que confirma que los mutantes de escape tenían tasas más bajas de resistencia a los anticuerpos que otras variantes.

¿Qué significa esto?

Los autores informan algunas ventajas importantes del método de detección basado en levadura. Es decir, que el método puede imitar con precisión la infección viral y la unión de anticuerpos, pero además proporciona un entorno de trabajo seguro, con una identificación relativamente rápida de mutantes de escape, así como un algoritmo de identificación “robusto y riguroso” de estos mutantes.

El equipo presenta este nuevo método de detección de levaduras como un recurso comunitario disponible abiertamente para que los científicos ayuden a acelerar el desarrollo de estrategias terapéuticas contra el SARS-CoV-2 y como una nueva herramienta para identificar mutaciones específicas resistentes a nAb.

Noticia importante

bioRxiv publica informes científicos preliminares que no son revisados ​​por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, guiar la práctica clínica / comportamiento relacionado con la salud o tratarse como información establecida.

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