Los investigadores identifican una nueva variante del SARS-CoV-2 (con la mutación V1230L) en Bengala Occidental, India


Los investigadores analizaron 2.000 genomas virales del síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2), el agente causante de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19), secuencias obtenidas de la India y encontraron una nueva variante que podría ser más infecciosa y transmisible.

La transmisión continua de SARS-CoV-2 ha provocado su mutación varias veces. Muchas de las nuevas mutaciones se encuentran en la proteína del pico del virus, que ha ayudado a la capacidad viral y a la supervivencia al hacerla más infecciosa y darle la capacidad de evadir el sistema inmunológico y anticuerpos neutralizantes.

Han surgido varias variantes preocupantes en diferentes partes del mundo, como la B.1.1.7 en el Reino Unido, la B.1.351 en Sudáfrica y la cepa P.1 en Brasil. Recientemente se han informado dos nuevas variantes de la India, las cepas B.1.617 y B.1.618, caracterizadas por varias mutaciones en la proteína de pico.

La frecuencia de la variante B.1.617 en la población aumentó significativamente a partir de febrero de 2021. Se informó que esta variante se observó en el Reino Unido, Estados Unidos y Singapur a fines de febrero de 2021, extendiéndose a más de 60 países en mayo de 2021.

Estudio: aparición de una nueva variante de SARS-CoV-2 del clado GR con una nueva mutación de la glicoproteína S V1230L en Bengala Occidental, India.  Haber de imagen: joshimerbin / Shutterstock

En un estudio publicado en el medRxiv* Preprint Server, los investigadores informan de la aparición de una nueva cepa del virus SARS-CoV-2 en el estado de Bengala Occidental en la India.

Analizando las secuencias del genoma

Los investigadores obtuvieron secuencias genómicas completas de 2.000 cepas de SARS-CoV-2 recolectadas entre enero y marzo de 2021 en la India de la base de datos GISAID. Realizaron un análisis mutacional, obtuvieron la secuencia de aminoácidos y compararon las secuencias con la cepa de Wuhan.

Después de un análisis más detallado, el equipo encontró 70 cepas con un nuevo conjunto de 11 mutaciones. Hubo tres mutaciones en las proteínas no estructurales, tres mutaciones en la proteína espiga y dos mutaciones en la proteína de la nucleocápsida.

Dieciséis de las secuencias tenían la mutación E484K junto con las mutaciones D614G, P681H y V1230L. Estas mutaciones caen en el clado GR, que tiene otras cuatro mutaciones que también estaban presentes en estas cepas. Un análisis más detallado de estas variantes reveló que estas cepas forman un nuevo grupo dentro del clado GR.

Las 70 secuencias de esta nueva cepa solo se han visto en el estado de Bengala Occidental. Además de las 12 mutaciones coexistentes, los investigadores encontraron otras 113 mutaciones diferentes.

Las mutaciones pueden aumentar la infecciosidad

P681 está presente junto al sitio de escisión de la furina, donde se produce la escisión proteolítica entre la arginina (R685) y la serina (S686). Este sitio está en la unión entre la subunidad S1, responsable de unirse al receptor de la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2), y la subunidad S2, responsable de la fusión entre la membrana celular y el virus. Por tanto, la presencia de una mutación en este sitio podría afectar la escisión de S1 / S2 y la infecciosidad del virus.

Análisis filogenético molecular de nuevas cepas variantes por Nextcladebeta v.0.14.3.  Árbol filogenético izquierdo que representa todas las cepas de referencia de diferentes clados de Nextstrain (seleccionados automáticamente por Nextclade), así como 70 cepas de la nueva variante.  Cada color representa un clado diferente.  Árbol filogenético derecho destacando solo las 70 secuencias de la nueva variante.

Molecular análisis filogenético de nuevas cepas variantes de Nextcladebeta v.0.14.3. Árbol filogenético izquierdo que representa todas las cepas de referencia de diferentes clados de Nextstrain (seleccionados automáticamente por Nextclade), así como 70 cepas de la nueva variante. Cada color representa un clado diferente. Árbol filogenético derecho destacando solo las 70 secuencias de la nueva variante.

La mutación P681H se ha visto antes en la variante del Reino Unido y se cree que aumenta la escisión de la proteína de pico, pero no parece afectar la entrada viral o su propagación. La mutación V1230L no se había visto antes y está ubicada en la región transmembrana de la subunidad S2, que ancla la proteína de pico a la envoltura del virus. La sustitución de valina por leucina podría incrementar la unión de la proteína de pico a la envoltura viral.

Las nuevas mutaciones podrían aumentar la infectividad y la transmisibilidad de la proteína y podrían disminuir la capacidad de los anticuerpos para neutralizar el virus. Con tasas de infectividad más altas reportadas en la segunda ola en India, las variantes emergentes deben ser monitoreadas de cerca.

*Noticia importante

medRxiv publica informes científicos preliminares que no son revisados ​​por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, guiar la práctica clínica / comportamiento relacionado con la salud o tratarse como información establecida.

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