Nuevas variantes del genoma del SARS-CoV-2 identificadas en el visón estadounidense


Investigadores de Canadá han descubierto dos variantes novedosas en las secuencias del gen del coronavirus 2 (SARS-CoV-2) del síndrome respiratorio agudo severo recogidas de visones en los Estados Unidos.

El virus SARS-CoV-2 es el agente responsable de la pandemia de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) que ahora se ha cobrado la vida de más de 2,78 millones de personas en todo el mundo.

El equipo identificó una variante de dos mutaciones (N501T-G142D) y una variante de tres mutaciones (N501T-G142D-F486L) en el SARS-CoV-2 proteína de pico – la estructura principal que utiliza el virus para unirse e infectar a las células.

El dominio de unión al receptor (RBD) de la espiga se une a la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2) del receptor de la célula huésped para permitir la fusión viral y la entrada celular.

Las dos variantes no se encontraron en las secuencias del gen SARS-CoV-2 derivadas del visón recolectadas en ningún otro país.

Hugh Cai de la Universidad de Guelph en Ontario y Allison Cai de la Universidad de British Colombia dicen que los hallazgos sugieren que las variantes evolucionaron durante la infección humana antes de propagarse a las poblaciones de visones.

El equipo dice que es vital monitorear las nuevas variantes emergentes para determinar su impacto en la salud humana y animal.

Una versión preimpresa del trabajo de investigación está disponible en el medRxiv* servidor, mientras que el artículo se somete a revisión por pares.

Estudio: las variantes del gen de la proteína de pico del SARS-CoV-2 con mutaciones N501T y G142D dominaron las infecciones en visones en los EE. UU.  Haber de imagen: Gallinago_media / Shutterstock

Estudio: las variantes del gen de la proteína de pico del SARS-CoV-2 con mutaciones N501T y G142D dominaron las infecciones en visones en los EE. UU. Haber de imagen: Gallinago_media / Shutterstock

El virus ha evolucionado rápidamente mutaciones en la proteína de pico.

Desde que se aisló la primera secuencia de SARS-CoV-2 de muestras recolectadas en Wuhan, China, en diciembre de 2019, el virus ha evolucionado rápidamente en mutaciones de proteínas de pico que han aumentado su transmisibilidad y virulencia.

A partir de 17th En marzo de 2021, el 22% de los genomas del SARS-CoV-2 dentro de la base de datos GISAID (Iniciativa global para compartir todos los datos sobre la influenza) contenían la mutación N501Y. Esta variante se ha identificado en la proteína de pico de los linajes más transmisibles y potencialmente más virulentos que surgieron recientemente en el Reino Unido (B.1.1.7), Sudáfrica (B.1.351) y Brasil (B.1.525).

En Dinamarca, también se descubrió que un gran número de visones estaban infectados con SARS-CoV-2 que contenía la mutación en espiga Y453F, lo que generó preocupaciones de que esta variante pudiera transmitirse de animales a humanos.

Cronología emergente de las variantes N501T-G142D y N501T-G142D-F486L del SARS-CoV-2 derivadas de humanos (por encima de la línea de tiempo) y del visón (por debajo de la línea de tiempo) en los EE. UU.  La escala de la línea de tiempo no es proporcional.

Cronología emergente de las variantes N501T-G142D y N501T-G142D-F486L del SARS-CoV-2 derivadas de humanos (por encima de la línea de tiempo) y del visón (por debajo de la línea de tiempo) en los EE. UU. La escala de la línea de tiempo no es proporcional.

¿Qué hicieron los investigadores?

Los investigadores se propusieron determinar las características genéticas de las secuencias de proteínas de pico del SARS-CoV-2 recolectadas de visones en los Estados Unidos y Canadá.

El equipo analizó todas las secuencias de SARS-CoV-2 derivadas de animales (977), todas las secuencias recopiladas en Canadá (19,529) y todas las secuencias recopiladas en los Estados Unidos (173,277) que se depositaron en GISAID entre diciembre de 2019 y el 12 de diciembre.th Marzo de 2021.

El aislado de SARS-CoV-2 Wuhan-Hu-1 recolectado el 19 de diciembre de 2019 se utilizó como referencia para el análisis de mutaciones.

La función “BLAST” del software de bioinformática “Geneious” se utilizó para determinar la incidencia de mutaciones nuevas a nivel local y mundial.

¿Qué reveló el análisis?

Ni la mutación N501Y compartida por las variantes del Reino Unido, Sudáfrica y Brasil ni la mutación Y453F identificada entre los visones en Dinamarca estaban presentes en ninguna de las secuencias del SARS-CoV-2 derivadas del visón de EE. UU. Y Canadá.

Sin embargo, el equipo identificó dos variantes novedosas dominantes en las secuencias de proteínas de pico recolectadas del visón en los EE. UU.: La doble mutación N501T-G142D y la triple mutación N501T-G142D-F486L.

Las variantes no se encontraron en secuencias recolectadas de visones en Canadá o en cualquier otro país.

Para determinar el origen de las nuevas variantes, los investigadores analizaron todas las secuencias de SARS-CoV-2 derivadas de humanos recolectadas de los EE. UU. Y Canadá.

Esto reveló que la mutación N501T (sin G142D o F486L) estaba presente en secuencias derivadas de humanos de EE. UU. Recolectadas ya en agosto de 2020, dos meses antes de que se recolectaran las secuencias derivadas de visones (octubre de 2020).

El equipo también dice que las variantes N501T-G142D y N501T-G142D-F486L se identificaron en las secuencias derivadas de humanos antes de que fueran identificadas en las secuencias derivadas de visones.

¿Cuáles son las implicaciones del estudio?

“Los resultados de este estudio indican que las nuevas variantes pueden haber evolucionado durante la infección humana y luego transmitirse a las poblaciones de visones en los Estados Unidos”, escribe el equipo.

Los investigadores dicen que la aparición de estas nuevas variantes en la población de visones justifica más estudios para establecer cómo pueden haber afectado la interacción de la espiga con ACE2 y, por lo tanto, la transmisibilidad viral, la virulencia y la inmunogenicidad en humanos y visones.

“Es importante monitorear las nuevas variantes emergentes y determinar su impacto en la salud humana y animal”, concluyen.

*Noticia importante

medRxiv publica informes científicos preliminares que no son revisados ​​por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, guiar la práctica clínica / comportamiento relacionado con la salud o tratarse como información establecida.

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