¿Qué papel jugó la variante delta del SARS-CoV-2 en la devastadora segunda ola de la India?


India tuvo una segunda ola sorprendentemente grande de enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) en 2021. Además de la propagación del virus al interior, en gran parte sin servicios de hospitales grandes con instalaciones de cuidados intensivos, el síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS) -CoV-2) parece haber adquirido nuevas características que contribuyeron en gran medida a su rápida y devastadora propagación por todo el país.

Estudio: Resurgimiento del SARS-CoV-2 en India: papel potencial de la variante B.1.617.2 (Delta) e intervenciones retrasadas.  Haber de imagen: joshimerbin / Shutterstock

Un informe detallado, disponible en el servidor de preimpresión medRxiv*, describe las diversas facetas de la segunda ola que la distinguen de la primera. El informe también contiene los hallazgos de un modelo SIR extendido que exploró los efectos potenciales de la intervención en varios puntos temporales de la segunda ola.

Argumentamos que una mejor vigilancia genómica junto con una evaluación constante del riesgo asociado con una mayor transmisión es fundamental para la capacidad de respuesta a una pandemia”, Escriben los autores del informe.

Historia de la segunda ola

Poco después de la primera detección del virus en India, apenas dos semanas después de la declaración oficial de COVID-19 como pandemia por parte de la Organización Mundial de la Salud (OMS), se declaró un bloqueo nacional que duró más de dos meses. En ese momento, había poco más de 500 casos en todo el país, con una población de más de 1.300 millones.

Después del 1 de junio de 2020, se implementó una relajación gradual del bloqueo, aunque con amplias variaciones locales de un estado a otro. Sin embargo, el recuento de casos continuó aumentando hasta el pico del 16 de septiembre, pero el tiempo de duplicación disminuyó drásticamente, al igual que el tasa de letalidad.

Una vez superado el pico, la incidencia de casos descendió a menos de 10.000 nuevos casos al día en febrero de 2021. Sin embargo, muchos estudios de seroprevalencia indican que se trata de una subestimación masiva del orden del 6% del total de casos.

Alrededor de este tiempo, se llevaron a cabo mítines políticos, multitudes electorales, festivales religiosos y algunos eventos sociales, lo que refleja el estado de ánimo entusiasta entre los altos funcionarios que afirmaron que la pandemia estaba en su “final”. Mientras tanto las vacunas Oxford-AstraZeneca como las autóctonas Covaxin se sometían a sus ensayos clínicos, se discutían las directrices operativas para implementar la vacunación a nivel nacional.

Dado que los trabajadores de la salud fueron el primer grupo en recibir la vacuna, la campaña se interrumpió el 16 de enero. Aún así, el ritmo fue lento, cubriendo menos del 1% del país durante el mes siguiente (nota: esto significa aproximadamente 8,7 millones de dosis ), y para el 1 de abril de 2021, más del 5% de la población, con una dosis.

Sin embargo, en febrero de 2021, Maharashtra, Chattisgarh y Punjab notaron un fuerte aumento en los casos, y el número de reproducción para todo el país superó 1, lo que indica una pandemia floreciente el catorce del mismo mes. No se ordenó ningún bloqueo a nivel nacional hasta el 14 de abril.

Para entonces, India había pasado por una prueba de fuego, con escasez aguda de oxígeno, sin camas de hospital y muertes que excedían la capacidad del sistema para deshacerse de los cadáveres decentemente. Aunque el número de víctimas oficial es lo suficientemente espantoso, muchas fuentes sugieren que se trata de un recuento insuficiente, y es posible que nunca se conozcan las cifras reales.

Varias variantes circulantes

Al mismo tiempo, la aparición de múltiples variantes se hizo evidente, al igual que en el mundo durante el invierno de 2020. El Consorcio indio de secuenciación del genoma del SARS-CoV-2 (INSACOG) se estableció en diciembre de 2020, aunque sus esfuerzos iniciales se vieron obstaculizados por una falta de reactivos Y equipamiento.

Sin embargo, la secuenciación temprana reflejó la presencia de variantes globales de preocupación, a saber, B.1.1.7, B.1.351 y P.1 (los VOC alfa, beta y gamma, respectivamente). En el período comprendido entre diciembre de 2020 y febrero de 2021, las variantes delta y kappa (B.1.617.2 y B.1.617.1, respectivamente) comprendieron el 60% de las secuencias de Maharashtra, y la primera fue etiquetada como VOC por la OMS en India. .

Otras variantes importantes incluyen el linaje B.1.36, que representa el 44% de los casos en Bengaluru, el centro de tecnología de la información en Karnataka. La variante alfa representó el 80% de los casos de Punjab, mientras que B.1.618 está pasando a primer plano en Bengala Occidental.

Números más altos de casos y muertes en la segunda ola

La proporción de tasas de casos diarias estandarizadas en todos los estados y territorios de la unión en la India muestra un valor superior a 1 y un valor medio de 3.8, lo que indica que la ola 2 golpeó al país mucho más fuerte que la ola 1. Las proporciones más altas se registraron en Uttarakhand e Himachal Pradesh , seguido de Punjab y Gujarat.

Cuando se trata de la proporción de tasas de mortalidad estandarizadas, prevalece la misma tendencia, con solo dos estados informando una proporción por debajo de 1, mientras que las tasas de muerte fueron significativamente más altas en la segunda ola para todas las demás regiones, la proporción media es de 3,2. Sin embargo, los estados más afectados tienen una proporción de 6,6 a 8,4.

La distribución máxima de casos también varió en la primera ola de la observada en la segunda ola. En el primero, el pico más temprano fue a fines de julio de 2020, para el estado sureño de Tamil Nadu, mientras que Himachal Pradesh registró el último, el 29 de noviembre.

Para la ola 2, el territorio himalaya de Ladakh registró su pico el 17 de abril de 2021, mientras que Mizoram alcanzó su punto máximo el 30 de mayo. La mayoría de los estados tuvo muchos más casos y muertes en la segunda ola, mientras que las muertes máximas en la ola 2 fueron cuatro veces más de la primera ola.

Variante delta mortal

Hacia el comienzo de la segunda ola, se descubrió que se habían introducido muchos COV en el país. La variante delta se convirtió en la cepa dominante, constituyendo más del 99% de todos los genomas secuenciados a finales de abril de 2021. Está asociada con resistencia a la neutralización mediada por anticuerpos, similar a la variante beta B.1.351.

También es probable que la variante delta sea más transmisible que la variante alfa B.1.1.7. En Maharashtra, donde la carga de casos ha sido la más alta y donde hay una gran cantidad de datos disponibles, este VOC pasó de formar el 1,5% del total al 87% entre febrero y mayo de 2021.

Usando un modelo de dos cepas, los investigadores combinaron datos de mortalidad con datos de distribución genómica descargados de la base de datos de la Iniciativa Global para Compartir Todos los Datos de Influenza (GISAID). A pesar de la gran escala de incertidumbre sobre la tasa de letalidad por infección (IFR), el modelo sugiere que si solo se supone que el 50% de las muertes se han perdido, según ellos, una suposición muy conservadora, y si se supone que la IFR es del 0,25%. , el número de muertes debido a la variante delta aumentó del 15% al ​​83% del 1 de abril al 15 de mayo de 2021.

En general, durante este período, el 55% de las muertes fueron causadas por este COV. Los científicos concluyeron que la cepa delta es mucho más transmisible que cualquier otro linaje anterior. Por lo tanto, esto respalda la idea de que el tamaño de la segunda ola no se debe solo a la disminución de la inmunidad o la relajación de las intervenciones no farmacéuticas (NPI), sino al cambio en la transmisibilidad del virus y la susceptibilidad a anticuerpos neutralizantes.

El bloqueo podría haber evitado miles de muertes

los científicos sugieren que un cierre temprano, alrededor del 15 al 30 de marzo de 2021, podría haber prevenido aproximadamente el 92% de los casos durante el mes siguiente. Esto habría resultado en un pico de entre 20.000 y 49.000 casos por día en lugar de más de 410.000, como sucedió realmente.

Un bloqueo posterior hasta el 15 de abril aún habría inducido una reducción, pero el efecto no es seguro, mientras que después de eso, la segunda ola habría alcanzado su punto máximo y ya estaría en declive.

Sin embargo, los resultados también muestran que la capacidad asistencial es de la mayor importancia ya que determina la tasa de letalidad. Con un CFR bajo, el tiempo y la intensidad del encierro son mucho menos significativos, con reducciones consistentemente marcadas en las muertes por encierro. Es decir, un bloqueo del 15 de marzo reduciría las muertes en un 98,5%, pero un bloqueo del 15 de abril aún reduciría el 92% de las muertes para el 15 de mayo.

¿Cuáles son las implicaciones?

A pesar de las obvias limitaciones del estudio, como la ausencia de datos sólidos sobre casos y muertes, ya sea en general o por edad, y la falta de incorporación de la implementación de la vacuna.

Además, el número de variantes circulantes en la India es alto en la actualidad, y los investigadores optaron por utilizar las estadísticas de Maharashtra, tanto por su mayor participación en el caso y la carga de mortalidad, como por la implementación del bloqueo en primer lugar. Por lo tanto, la transmisión continua del virus refuerza la teoría de que el virus delta está preparado epidemiológicamente para propagarse rápida y ampliamente, superando las barreras inmunitarias preexistentes.

No obstante, la vacunación parece ser la forma más eficaz de avanzar para prevenir aún más casos y muertes. Esto es a pesar del hecho de que, como señalan los investigadores, la variante B.1.617 reduce la neutralización de anticuerpos en un 50% y un 67% entre aquellos con antecedentes de infección natural y vacunación, respectivamente.

Dado que la vacunación de toda la población llevará necesariamente un tiempo, y dada la grave escasez actual de vacunas en todo el mundo, los científicos también concluyen que las intervenciones de salud pública no farmacéuticas, aplicado en un tiempo manera, seguirá siendo la clave para contener COVID-19 en la India.

En resumen, si se hubieran tomado medidas en cualquier momento de marzo, es plausible que más del 90% de los casos y muertes observados entre el 1 de marzo y el 15 de mayo pudieran potencialmente evitarse en escenarios de intervención fuerte y moderada.. “

La vigilancia genómica y viral meticulosa y a gran escala será aún más necesaria para pronosticar y prepararse para las olas futuras mediante la construcción de infraestructura, la capacitación del personal y la recopilación y el uso de datos de manera adecuada.

Es necesario priorizar la secuenciación de las reinfecciones, así como las infecciones por avance de las vacunas, para comprender la eficacia de la vacuna y las necesidades de desarrollo frente a las variantes de preocupación emergentes.”Concluyen los autores.

*Noticia importante

medRxiv publica informes científicos preliminares que no son revisados ​​por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, guiar la práctica clínica / comportamiento relacionado con la salud o tratarse como información establecida.

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