Un estudio revela un repertorio previamente no detectado de genes impulsores del cáncer

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Un nuevo estudio, dirigido por investigadores de la Universidad de California en Irvine, ha profundizado la comprensión de los mecanismos epigenéticos en la tumorigénesis y ha revelado un repertorio de genes impulsores del cáncer no detectado previamente. El estudio fue publicado esta semana en Avances científicos.

Usando un nuevo algoritmo de predicción, llamado DORGE (Descubrimiento de oncogenes y genes supresores de tumores usando características genéticas y epigenéticas), los investigadores pudieron identificar nuevos genes supresores de tumores (TSG) y oncogenes (OG), particularmente aquellos con mutaciones raras, integrando el colección más completa de datos genéticos y epigenéticos.

“Los algoritmos bioinformáticos existentes no aprovechan suficientemente las características epigenéticas para predecir los genes impulsores del cáncer, a pesar del hecho de que se sabe que las alteraciones epigenéticas están asociadas con los genes impulsores del cáncer”, dijo el autor principal Wei Li, PhD, presidente de Grace B. Bell y profesor de bioinformática en el Departamento de Química Biológica de la Facultad de Medicina de la UCI. “Nuestro algoritmo computacional integra datos públicos sobre alteraciones epigenéticas y genéticas, para mejorar la predicción de genes impulsores del cáncer”.

El cáncer es el resultado de una acumulación de alteraciones genéticas clave que alteran el equilibrio entre la división celular y la apoptosis. Los genes con mutaciones “impulsoras” que afectan la progresión del cáncer se conocen como genes impulsores del cáncer y pueden clasificarse como TSG y oncogenes OG según sus funciones en la progresión del cáncer.

Este estudio demostró cómo los genes impulsores del cáncer, predichos por DORGE, incluían genes impulsores del cáncer conocidos y genes impulsores novedosos que no se informan en la literatura actual. Además, los investigadores encontraron que los nuevos genes de doble función, que DORGE predijo como TSG y OG, están altamente enriquecidos en los centros de interacción proteína-proteína (PPI) y redes de fármacos / compuestos-genes.

“Nuestro algoritmo DORGE aprovechó con éxito los datos públicos para descubrir las alteraciones genéticas y epigenéticas que desempeñan un papel importante en la desregulación de los genes impulsores del cáncer”, explicó Li. “Estos hallazgos podrían ser fundamentales para mejorar los esfuerzos de prevención, diagnóstico y tratamiento del cáncer en el futuro”.

Fuente:

Referencia de la revista:

Lyu, J., et al. (2020) DORGE: Descubrimiento de oncogenes y genes supresores de tumoR usando características genéticas y epigenéticas. Avances científicos. doi.org/10.1126/sciadv.aba6784.

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